MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 50717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_015562	TAA	2	6	217136	217141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910101
6003	NC_015562	A	7	7	217158	217164	100 %	0 %	0 %	0 %	333910101
6004	NC_015562	GAAA	2	8	217167	217174	75 %	0 %	25 %	0 %	333910101
6005	NC_015562	A	6	6	217275	217280	100 %	0 %	0 %	0 %	333910101
6006	NC_015562	CTT	2	6	217323	217328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910101
6007	NC_015562	GAG	2	6	217375	217380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910101
6008	NC_015562	T	6	6	217444	217449	0 %	100 %	0 %	0 %	333910101
6009	NC_015562	AGA	2	6	217464	217469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910101
6010	NC_015562	ATT	2	6	217513	217518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910101
6011	NC_015562	GAAG	2	8	217537	217544	50 %	0 %	50 %	0 %	333910101
6012	NC_015562	ATT	2	6	217696	217701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910101
6013	NC_015562	GA	3	6	217713	217718	50 %	0 %	50 %	0 %	333910101
6014	NC_015562	GAA	2	6	217795	217800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910101
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6016	NC_015562	ATA	2	6	217843	217848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910101
6017	NC_015562	AAC	2	6	217989	217994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910101
6018	NC_015562	A	6	6	218035	218040	100 %	0 %	0 %	0 %	333910101
6019	NC_015562	GAA	2	6	218041	218046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910101
6020	NC_015562	TAT	2	6	218053	218058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910101
6021	NC_015562	TGA	2	6	218072	218077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910101
6022	NC_015562	A	6	6	218104	218109	100 %	0 %	0 %	0 %	333910101
6023	NC_015562	GAA	2	6	218164	218169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910101
6024	NC_015562	TAA	2	6	218172	218177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910101
6025	NC_015562	A	6	6	218176	218181	100 %	0 %	0 %	0 %	333910101
6026	NC_015562	AGAAA	2	10	218194	218203	80 %	0 %	20 %	0 %	333910101
6027	NC_015562	ATT	2	6	218234	218239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910101
6028	NC_015562	A	6	6	218261	218266	100 %	0 %	0 %	0 %	333910101
6029	NC_015562	GAT	2	6	218281	218286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910101
6030	NC_015562	GAA	2	6	218293	218298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910101
6031	NC_015562	TTG	2	6	218300	218305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910101
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6033	NC_015562	GTG	2	6	218334	218339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910101
6034	NC_015562	GAG	2	6	218340	218345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910101
6035	NC_015562	GGA	2	6	218373	218378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910101
6036	NC_015562	TTA	2	6	218431	218436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910101
6037	NC_015562	TTG	2	6	218456	218461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910101
6038	NC_015562	AG	3	6	218470	218475	50 %	0 %	50 %	0 %	333910101
6039	NC_015562	TTA	3	9	218486	218494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910101
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6041	NC_015562	AGT	2	6	218520	218525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910101
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6043	NC_015562	GGA	2	6	218578	218583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910101
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6045	NC_015562	CTTT	2	8	218696	218703	0 %	75 %	0 %	25 %	333910101
6046	NC_015562	GAA	2	6	218704	218709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910101
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6050	NC_015562	AG	3	6	218950	218955	50 %	0 %	50 %	0 %	333910102
6051	NC_015562	GAG	2	6	219005	219010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910102
6052	NC_015562	AGG	2	6	219012	219017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910102
6053	NC_015562	A	6	6	219055	219060	100 %	0 %	0 %	0 %	333910102
6054	NC_015562	TAT	2	6	219128	219133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910102
6055	NC_015562	CTA	2	6	219136	219141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910102
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6057	NC_015562	AGGG	2	8	219224	219231	25 %	0 %	75 %	0 %	333910102
6058	NC_015562	A	6	6	219261	219266	100 %	0 %	0 %	0 %	333910102
6059	NC_015562	CCA	2	6	219284	219289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910102
6060	NC_015562	A	6	6	219314	219319	100 %	0 %	0 %	0 %	333910102
6061	NC_015562	G	6	6	219352	219357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015562	GAAA	2	8	219368	219375	75 %	0 %	25 %	0 %	333910103
6063	NC_015562	GAA	2	6	219447	219452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910103
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6065	NC_015562	ATG	2	6	219578	219583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910103
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6071	NC_015562	TGA	2	6	219750	219755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910103
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6073	NC_015562	ATG	2	6	219773	219778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910103
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6093	NC_015562	A	6	6	220242	220247	100 %	0 %	0 %	0 %	333910103
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6099	NC_015562	TTA	2	6	220540	220545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910104
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6102	NC_015562	ATC	2	6	220590	220595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_015562	TTTA	2	8	220630	220637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015562	T	6	6	220638	220643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015562	TCA	2	6	220688	220693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015562	GCTTC	2	10	220707	220716	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6107	NC_015562	A	7	7	220755	220761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_015562	CTA	2	6	220809	220814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015562	A	6	6	220814	220819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_015562	A	6	6	220867	220872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_015562	CTT	2	6	220873	220878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_015562	T	6	6	220877	220882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015562	AGA	2	6	220997	221002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015562	AGAGA	2	10	221004	221013	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015562	T	6	6	221123	221128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015562	AAG	2	6	221133	221138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015562	TTAA	2	8	221187	221194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015562	TCA	2	6	221206	221211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_015562	AT	3	6	221212	221217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_015562	GA	3	6	221483	221488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_015562	GTT	2	6	221499	221504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015562	GTT	2	6	221536	221541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015562	TA	3	6	221623	221628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015562	CTT	2	6	221643	221648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_015562	TA	3	6	221691	221696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015562	AAT	2	6	221731	221736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6128	NC_015562	A	6	6	221818	221823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6380	NC_015562	GAA	2	6	231161	231166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
6381	NC_015562	AGA	2	6	231172	231177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
6382	NC_015562	A	6	6	231184	231189	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6383	NC_015562	TAAA	2	8	231195	231202	75 %	25 %	0 %	0 %	333910116
6384	NC_015562	TAC	2	6	231214	231219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910116
6385	NC_015562	GTT	2	6	231248	231253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910116
6386	NC_015562	T	7	7	231252	231258	0 %	100 %	0 %	0 %	333910116
6387	NC_015562	CTG	2	6	231315	231320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910116
6388	NC_015562	A	6	6	231324	231329	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6389	NC_015562	ATT	2	6	231336	231341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910116
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6391	NC_015562	GAGG	2	8	231460	231467	25 %	0 %	75 %	0 %	333910116
6392	NC_015562	CTT	2	6	231484	231489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910116
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6394	NC_015562	TAA	2	6	231529	231534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
6395	NC_015562	A	6	6	231533	231538	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6396	NC_015562	TAA	2	6	231597	231602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
6397	NC_015562	CAA	2	6	231654	231659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910116
6398	NC_015562	GCTAT	2	10	231726	231735	20 %	40 %	20 %	20 %	333910116
6399	NC_015562	TGG	2	6	231787	231792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910116
6400	NC_015562	TGA	2	6	231808	231813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910116
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6404	NC_015562	AG	3	6	231966	231971	50 %	0 %	50 %	0 %	333910116
6405	NC_015562	TGA	2	6	231979	231984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910116
6406	NC_015562	AAATAA	2	12	232017	232028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333910116
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6411	NC_015562	A	6	6	232174	232179	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6412	NC_015562	A	6	6	232194	232199	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6413	NC_015562	ATA	2	6	232209	232214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
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6416	NC_015562	AAG	2	6	232324	232329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
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6418	NC_015562	TATAAT	2	12	232343	232354	50 %	50 %	0 %	0 %	333910116
6419	NC_015562	ATT	2	6	232363	232368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910116
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6423	NC_015562	AT	3	6	232557	232562	50 %	50 %	0 %	0 %	333910116
6424	NC_015562	AT	3	6	232582	232587	50 %	50 %	0 %	0 %	333910116
6425	NC_015562	A	6	6	232590	232595	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
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6429	NC_015562	GAA	2	6	232652	232657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
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6431	NC_015562	TTAAA	2	10	232776	232785	60 %	40 %	0 %	0 %	333910116
6432	NC_015562	TAA	2	6	232786	232791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
6433	NC_015562	A	6	6	232826	232831	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6434	NC_015562	TATTGC	2	12	232848	232859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333910116
6435	NC_015562	CAT	2	6	232878	232883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910116
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6437	NC_015562	A	7	7	232955	232961	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
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6440	NC_015562	A	6	6	233045	233050	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6441	NC_015562	AG	3	6	233090	233095	50 %	0 %	50 %	0 %	333910116
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6450	NC_015562	TGA	2	6	233365	233370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910116
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6453	NC_015562	AGA	2	6	233599	233604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
6454	NC_015562	A	7	7	233609	233615	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
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6456	NC_015562	A	6	6	233681	233686	100 %	0 %	0 %	0 %	333910116
6457	NC_015562	AT	3	6	233732	233737	50 %	50 %	0 %	0 %	333910117
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6467	NC_015562	AAG	2	6	234201	234206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910117
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6470	NC_015562	A	6	6	234324	234329	100 %	0 %	0 %	0 %	333910117
6471	NC_015562	GA	4	8	234376	234383	50 %	0 %	50 %	0 %	333910117
6472	NC_015562	TA	3	6	234391	234396	50 %	50 %	0 %	0 %	333910117
6473	NC_015562	AAT	2	6	234414	234419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910117
6474	NC_015562	GAA	2	6	234522	234527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910117
6475	NC_015562	GA	3	6	234568	234573	50 %	0 %	50 %	0 %	333910117
6476	NC_015562	A	6	6	234704	234709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6477	NC_015562	AAAT	2	8	234750	234757	75 %	25 %	0 %	0 %	333910118
6478	NC_015562	AAT	2	6	234760	234765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910118
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6481	NC_015562	TAA	2	6	234837	234842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910118
6482	NC_015562	TAAT	2	8	234849	234856	50 %	50 %	0 %	0 %	333910118
6483	NC_015562	TAGAT	2	10	234859	234868	40 %	40 %	20 %	0 %	333910118
6484	NC_015562	GA	4	8	234901	234908	50 %	0 %	50 %	0 %	333910118
6485	NC_015562	ATG	2	6	234924	234929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910118
6486	NC_015562	TTTG	2	8	234943	234950	0 %	75 %	25 %	0 %	333910118
6487	NC_015562	ATA	2	6	234983	234988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910118
6488	NC_015562	GTTCCA	2	12	235025	235036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333910118
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6490	NC_015562	A	7	7	235064	235070	100 %	0 %	0 %	0 %	333910118
6491	NC_015562	CCA	2	6	235071	235076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910118
6492	NC_015562	AT	3	6	235090	235095	50 %	50 %	0 %	0 %	333910118
6493	NC_015562	A	6	6	235118	235123	100 %	0 %	0 %	0 %	333910118
6494	NC_015562	ATT	2	6	235142	235147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910118
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6497	NC_015562	T	6	6	235378	235383	0 %	100 %	0 %	0 %	333910118
6498	NC_015562	TAAA	2	8	235398	235405	75 %	25 %	0 %	0 %	333910118
6499	NC_015562	AGG	2	6	235447	235452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910118
6500	NC_015562	TA	3	6	235472	235477	50 %	50 %	0 %	0 %	333910118

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